<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=UTF-8" http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <font size="-1">Thanks!<br>
      <br>
      Mark<br>
      <br>
    </font>
    <div class="moz-cite-prefix">On 3/11/2014 12:04 PM, kris kvilekval
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote cite="mid:1394561099.20139.29.camel@loup.ece.ucsb.edu"
      type="cite">
      <pre wrap="">Hi, 

  I was going to announce it here when we release to stable, but based
on the question I thought it might be worthwhile to let you know 
sooner.

We have integrated openslide into our online platform for bioimage
management, annotation, and analysis (BISQUE) developed by the 
center for bioimage informatics at UCSB. 

BISQUE supports over 200+ bioimaging formats including 5D imaging (3D +
time + multi-channel) and is very scalable.  Bisque allows graphical
and textual annotations and can link data into complex graphs that are
searchable and analyzible. Analysis, provenance and flexible data
modeling are core to bisque.

More info here:
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.bioimage.ucsb.edu/bisque">http://www.bioimage.ucsb.edu/bisque</a>

We will deploy an openslide-enabled bisque to stable sometime next week
and it will be available full-time at <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://bisque.ece.ucsb.edu">http://bisque.ece.ucsb.edu</a> (our
main bisque server) for public use.  We are wrapping up or 0.55 release
this week.

I will post a note here when we go online next week.


 

On Tue, 2014-03-11 at 11:48 -0600, Mark Ungrin wrote:
</pre>
      <blockquote type="cite">
        <pre wrap="">What additional work would be required for OpenSlide to support
annotations (ideally in the web browser)?

thanks

Mark
-- 
Dr. Mark Ungrin, Ph.D.
Assistant Professor
Department of Comparative Biology &amp; Experimental Medicine
HMRB 320, 3330 Hospital Drive NW
Calgary, AB  T2N 4N1
University of Calgary, Faculty of Veterinary Medicine

Email: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:mark.ungrin@ucalgary.ca">mark.ungrin@ucalgary.ca</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.ucalgary.ca/ungrinlab">http://www.ucalgary.ca/ungrinlab</a>

office: 403.210.6203
cell: 403.561.6817
lab: 403.210.6545
fax:    403.210.8821

The information contained in this e-mail is only for the use of the individual or entity to whom it is intended. Its contents (including any attachments) are confidential and may contain privileged information. If you are not an intended recipient you must not use, disclose, disseminate, copy or print its contents. If you receive this e-mail in error, please notify the sender by e-mail and delete and destroy the message and all copies.
_______________________________________________
openslide-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:openslide-users@lists.andrew.cmu.edu">openslide-users@lists.andrew.cmu.edu</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://lists.andrew.cmu.edu/mailman/listinfo/openslide-users">https://lists.andrew.cmu.edu/mailman/listinfo/openslide-users</a>
</pre>
      </blockquote>
      <pre wrap="">

</pre>
    </blockquote>
    <br>
    <pre class="moz-signature" cols="72">-- 
Dr. Mark Ungrin, Ph.D.
Assistant Professor
Department of Comparative Biology &amp; Experimental Medicine
HMRB 320, 3330 Hospital Drive NW
Calgary, AB  T2N 4N1
University of Calgary, Faculty of Veterinary Medicine

Email: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:mark.ungrin@ucalgary.ca">mark.ungrin@ucalgary.ca</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.ucalgary.ca/ungrinlab">http://www.ucalgary.ca/ungrinlab</a>

office: 403.210.6203
cell: 403.561.6817
lab: 403.210.6545
fax:    403.210.8821

The information contained in this e-mail is only for the use of the individual or entity to whom it is intended. Its contents (including any attachments) are confidential and may contain privileged information. If you are not an intended recipient you must not use, disclose, disseminate, copy or print its contents. If you receive this e-mail in error, please notify the sender by e-mail and delete and destroy the message and all copies.</pre>
  </body>
</html>