<font size=2 face="sans-serif">Hi list,</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">For comparison's sake, these are our
settings. We have two MRXS scanners:</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">* Version 1.12.25.1 (Windows XP):</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">JPEG 80%</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">Fine focus frequency: 5</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">Coarse focus frequency: 9</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">stitching: on</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">Brightfield compensation: off</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">* Version 2 (Windows 7):</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">JPEG 80%</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">Interpolated focus distance: 15</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">Stitching: on</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">Brightfield compensation: off</font>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br><font size=1 color=#5f5f5f face="sans-serif">From: &nbsp; &nbsp; &nbsp;
&nbsp;</font><font size=1 face="sans-serif">&quot;Priv.-Doz. Dr.
M. Weihrauch&quot; &lt;martin.weihrauch@uni-koeln.de&gt;</font>
<br><font size=1 color=#5f5f5f face="sans-serif">To: &nbsp; &nbsp; &nbsp;
&nbsp;</font><font size=1 face="sans-serif">openslide-users@lists.andrew.cmu.edu</font>
<br><font size=1 color=#5f5f5f face="sans-serif">Date: &nbsp; &nbsp; &nbsp;
&nbsp;</font><font size=1 face="sans-serif">09-08-13 09:10</font>
<br><font size=1 color=#5f5f5f face="sans-serif">Subject: &nbsp; &nbsp;
&nbsp; &nbsp;</font><font size=1 face="sans-serif">Re: unreadable
mirax file</font>
<br><font size=1 color=#5f5f5f face="sans-serif">Sent by: &nbsp; &nbsp;
&nbsp; &nbsp;</font><font size=1 face="sans-serif">openslide-users-bounces+sucaet=histogenex.com@lists.andrew.cmu.edu</font>
<br>
<hr noshade>
<br>
<br>
<br><tt><font size=2>Benjamin:<br>
<br>
Here are the properties of the MIRAX-scanner that was used in the lab,<br>
which produced the errors in openslide:<br>
<br>
Scanner: Panoramic 250<br>
Software-Version: 1.15<br>
<br>
Picture Settings:<br>
JPEG 80%<br>
Interpolate focus distance: 10<br>
Stitching: on<br>
Brightfield Compensation: off<br>
<br>
Martin<br>
<br>
Am 06.08.2013 05:16, schrieb Benjamin Gilbert:<br>
&gt; On 08/05/2013 04:43 AM, Priv.-Doz. Dr. M. Weihrauch wrote:<br>
&gt;&gt; John was so nice to post this file here. I have more images from
the<br>
&gt;&gt; same scanner that seem to have the same problem, I uploaded one
more<br>
&gt;&gt; image (appr. 300 MB) here:<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; </font></tt><a href=http://www.smartinmedia.com/stuff/A12.zip><tt><font size=2>http://www.smartinmedia.com/stuff/A12.zip</font></tt></a><tt><font size=2><br>
&gt; Same problem, same value (1253). &nbsp;Odd.<br>
&gt;<br>
&gt;&gt; I asked the lab, which scanner, which software version and what
settings<br>
&gt;&gt; they use and will post this as soon as I have it<br>
&gt; Thanks.<br>
&gt;<br>
&gt; I've committed a fix:<br>
&gt;<br>
&gt; &nbsp; &nbsp; &nbsp;</font></tt><a href=https://github.com/openslide/openslide/commit/54561528><tt><font size=2>https://github.com/openslide/openslide/commit/54561528</font></tt></a><tt><font size=2><br>
&gt;<br>
&gt; --Benjamin Gilbert<br>
&gt;<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; openslide-users mailing list<br>
&gt; openslide-users@lists.andrew.cmu.edu<br>
&gt; </font></tt><a href="https://lists.andrew.cmu.edu/mailman/listinfo/openslide-users"><tt><font size=2>https://lists.andrew.cmu.edu/mailman/listinfo/openslide-users</font></tt></a><tt><font size=2><br>
&gt;<br>
<br>
<br>
-- <br>
---------------------------------<br>
Priv.-Doz. Dr. med. Martin Weihrauch<br>
Facharzt für Innere Medizin,<br>
Hämatologie und internistische Onkologie<br>
Ärztlicher Geschäftsführer des<br>
MVZ der Uniklinik Köln<br>
50924 Köln<br>
Tel: 0221-47886615<br>
Fax: 0221-47886616<br>
<br>
_______________________________________________<br>
openslide-users mailing list<br>
openslide-users@lists.andrew.cmu.edu<br>
</font></tt><a href="https://lists.andrew.cmu.edu/mailman/listinfo/openslide-users"><tt><font size=2>https://lists.andrew.cmu.edu/mailman/listinfo/openslide-users</font></tt></a><tt><font size=2><br>
</font></tt>
<br>
<br><HR><BR>WARNING: This e-mail, including any attachments, may contain CONFIDENTIAL INFORMATION, including privileged and/or health information.  It is for the sole use of the intended recipients. Any unauthorized copying, disclosure, distribution, reproduction, use or retention of this email or the information in it, is strictly FORBIDDEN. If you are not an intended recipient, please notify the sender immediately (REPLY this e-mail) and permanently DELETE the related e-mail.  Please be aware that this email and replies to it may be monitored by the sender's company for quality assurance, policy compliance and/or security purposes.

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