<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle" type="text/css">
<!--
p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}
-->
</style>
</head>
<body>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt">I've been trying different ways to export MRXS files into a format that can be read by ImageJ.&nbsp; I was wondering if anyone had a prefered method/script/flow logic that works consistently
 and well.&nbsp; My shots have all been pretty slow, and often have artifacts.&nbsp; We are hoping to get out 1:1 images, and even the vendor software tends to crash on that.<br>
<br>
Our eventual goal is not to have to define the ROI ourselves so if anyone has better program idea for that, I'd be happy to listen (better than ImageJ).&nbsp; We run into the problem in that there is not a consistent way to stain our ROI, the airway epithelium,
 so many blob detections won't work well.<br>
<br>
Thanks,<br>
Michael<br>
<br>
<div><br>
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">-- <br>
Michael Currier<br>
Emory School of Medicine, Pediatrics, Infectious Diseases<br>
Lab Manager, Moore Lab<br>
<br>
<br>
o:<i>removed</i><br>
c:<i>removed</i><br>
e: mgcurri@emory.edu<br>
<br>
Emory Children's Center R:510-P<br>
2015 UPPERGATE DRIVE<br>
ATLANTA, GA 30322<br>
United States<br>
<font color="#000000" face="Tahoma" size="2"></font></div>
</div>
</div>
<br>
<hr>
<font face="Arial" color="Gray" size="1"><br>
This e-mail message (including any attachments) is for the sole use of<br>
the intended recipient(s) and may contain confidential and privileged<br>
information. If the reader of this message is not the intended<br>
recipient, you are hereby notified that any dissemination, distribution<br>
or copying of this message (including any attachments) is strictly<br>
prohibited.<br>
<br>
If you have received this message in error, please contact<br>
the sender by reply e-mail message and destroy all copies of the<br>
original message (including attachments).<br>
</font>
</body>
</html>