<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:st1="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">

<head>
<meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name=Generator content="Microsoft Word 11 (filtered medium)">
<!--[if !mso]>
<style>
v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style>
<![endif]--><o:SmartTagType
 namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="PersonName"/>
<!--[if !mso]>
<style>
st1\:*{behavior:url(#default#ieooui) }
</style>
<![endif]-->
<style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:Arial;
        color:navy;}
@page Section1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.25in 1.0in 1.25in;}
div.Section1
        {page:Section1;}
-->
</style>

</head>

<body lang=EN-US link=blue vlink=purple>

<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>Hello I have been running Openslide Java
in windows XP for several months. I just take the win binaries in the Openslide
website for the C code, and put it in the class path. I have no problems but I
have not tried to compile the C code or generate the C-libraries myself (the
dll files) but I use the one given in the website. Actually I do not run the Java
code from the jar file but from the source code as I have to change and add
Java classes for the purpose of my application. The directory structure is the
project root contains the C-library files (or dll files), the src/ directory
with the Java code and the bin/ directory with the classes. <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>Elena<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'>&nbsp;<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<div>

<div class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><font size=3
face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'>

<hr size=2 width="100%" align=center tabindex=-1>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal><b><font size=2 face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Tahoma;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font size=2
face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;font-family:Tahoma'>
openslide-users-bounces+villalel=umdnj.edu@lists.andrew.cmu.edu
[mailto:openslide-users-bounces+villalel=umdnj.edu@lists.andrew.cmu.edu] <b><span
style='font-weight:bold'>On Behalf Of </span></b>Peter Cooper<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Sent:</span></b> Thursday, December 09, 2010
3:47 PM<br>
<b><span style='font-weight:bold'>To:</span></b> <st1:PersonName w:st="on">openslide-users@lists.andrew.cmu.edu</st1:PersonName><br>
<b><span style='font-weight:bold'>Subject:</span></b> Implementing Openslide,
Openslide-Java, and PathFind on Windows XP and Cygwin</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'>I am attempting to implement Openslide, Openslide-Java, and PathFind on
a Windows XP system, using Cygwin. This is proving to be a daunting task, eg,
CMake had a script with carriage returns embedded that had to be cleansed with
TR. I am hoping to set up an installation manual,or at least some documentation
so that clinical research types don't have to start from ground zero. Any
assistance would be greatly appreciated. My applications are molecular
diagnostics, eg ERBB2, or 1p19q, as well as morphometric analysis, via ImageJ,
of kidney biopsies.<o:p></o:p></span></font></p>

</div>

</body>

</html>